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ESFERA REBOTANDO

En esta animación se utiliza dinámica molecular tipo time-driven. La animación muestra el movimiento bajo acción de la gravedad de una esfera en una caja incluyendo un término disipativo. Para la evolución de la partícula y las interacciones con las paredes se utilizó un algoritmo tipo leap-frog. 

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ACETÍLCOLINA

La animación representa la gota inicial del neurotransmisor Acetilcolina sobre la superficie de la terminal postsinaptica de la union neuromuscular las pepitas verdes representan Ach (acetilcolina) libre, las blancas reaccion de dos moleculas del neurotransmisor con receptores nicotinicos, las zonas amarillas (escasas) reaccion de un receptor con una sola molecula y la concentracion disminuye con el tiempo debido a la enzima hidrolizante AChE (acetilcolinesterasa.) 

TROMPO

Esta animación muestra la rotación de un trompo pesado. El trompo es un cuerpo rígido que en este caso es establecido como simétrico, un cono, el cual satisface que dos de sus momentos principales de inercia sean iguales. Se considera que el trompo sólo está bajo la influencia de la fuerza de gravedad y se impone la condición de un punto fijo en el espacio (la punta del cono). Para solucionar las ecuaciones de movimiento de los ángulos de Euler, se implementa el método de cuaterniones. Es de resaltar que en la animación en notorio el cabeceo, o ángulo de nutación, el cual es característico en un trompo.  

PILA DE ARENA

Esta animación muestra la construcción de una pila de arena, utilizando el autómata celular desarrollado en el trabajo de maestría de María del Pilar Sáenz. La forma de la pila reproduce los resultados obtenidos con otros autómatas y los resultados experimentales previos.

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CANAL GRAMICIDINA A

La animación muestra el canal Gramicidina A en una membrana celular. En el medio acuoso intracelular y extracelular se encuentran cationes y aniones, que se mueven describiendo una trayectoria browniana. El canal sólo permite el paso de cationes monovalentes como potasio o sodio.

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VARIAS ESFERAS (EVENT DRIVEN)

Estas animaciones son ejemplos de las colisiones posibles para un arreglo hexagonal de siete partículas, incluida una central, con masas y radios identicos. En el primer caso se tienen siete partículas y de ellas solamente a tres se les asigna una velocidad inicial. En la segunda animación se consideran sólo dos partículas que se dirigen hacia el centro que está vacío. En el tercer caso, se consideran dos partículas, dos de ellas diriguiéndose hacia una tercera estática. En todos los casos para el estudio de la evolución del sistema se utilizó dinámica molecular tipo event-driven. Para las colisiones se implementó un algoritmo que considera tres parámetros, el coeficiente de restitución normal, el coeficiente de fricción y el coeficiente de máxima restitución tangencial.

Descargar: Siete Tres Dos

 

MEDIO GRANULAR

Esta es una de las primeras implementaciones realizadas con el autómata de la tesis de María del Pilar Sáenz, muestra unas partículas cayendo bajo la acción de la gravedad y rebotando con las paredes y el piso.


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MEDIO GRANULAR VIBRANDO

Esta animación s una de las animaciones finales obtenidas con el autómata de la tesis de maestría de María del Pilar Sáenz. Se muestra un material granular sometido a vibración vertical..


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LIFE

Este es LIFE, uno de los autómatas celulares más conocidos.


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HPP GAS



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2 ESFERAS (EVENT DRIVEN)

Ésta e s una de las primeras animaciones que realizó María del Pilar Sáenz utilizando dinámica molecular tipo event-driven. Básicamente es el resultado de aplicar un algoritmo de dinámica molecular para dos esferas y cuatro paredes en el plano. El programa original calcula los tiempos de choque entre las partículas y de cada partícula con las paredes, escoge el menor tiempo de estos para seguir la evolución temporal del sistema y realiza luego una colisión elástica. La animación muestra la evolución temporal de estas dos partículas.

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